臺南市長黃偉哲認為，改善河川污染不僅是有利水質，同時也是在涵養、保護水中生態，因此，為改善臺南市河川水質，減少民生污染排入河川，責成市府相關單位務必加速整治作業，水利局亦積極推動污水下水道系統建設及水質淨化工程，並持續爭取中央補助經費，辦理本市急水溪、鹽水溪、二仁溪、七股溪及竹溪流域水質改善工作。
水利局表示，目前運作中的污水下水道系統包括安平、柳營、官田、安南、虎尾寮及仁德等6大系統，總計可處理污水量達20萬9,500CMD，得以有效削減民生污水污染量，避免家戶生活污水直接流入河川造成水質污染。
由於污水下水道系統屬長期的基礎建設，在推動污水下水道建設的同時，為加速水質改善成效，本市自100年起持續向行政院環境保護署爭取補助經費，共計獲得13億5,000萬元建設經費，新建13座水質淨化場，總計每日處理量達高達11萬3,500噸，水質淨化場分布在急水溪、鹽水溪、二仁溪、竹溪、七股溪等臺南市重要流域，透過截流污染程度高的河川晴天污水至水質淨化場處理後再排放回河川，能有效削減水中7成污染物質，並提升水中溶氧，進而改善水質。
水利局進一步表示，透過污水用戶接管工程搭配河川污水截流工程，可有效淨化臺南市河川水質，使嚴重污染河段比例逐年下降。參考環保署100年至109年期間嚴重污染河川長度統計資料，109年度各河川嚴重污染長度比例與往年相比，急水溪下降約14%、鹽水溪下降約24%、二仁溪則下降13%，顯示市府長期推動污水下水道建設、水質淨化設施及環保稽查源頭管理等河川污染控制策略奏效。
市府推動水質改善工作不遺餘力，為進一步改善三爺溪水質，水利局再於110年3月獲行政院環境保護署補助7億8,360萬元的工程經費，辦理三爺溪上游排水截流及虎尾寮水資源回收中心擴建工程，透過截流三爺溪網寮橋上游24,000CMD晴天污水至虎尾寮水資中心處理，以減少三爺溪污染負荷，並因應截流水量增加，另將虎尾寮水資源回收中心每日處理水量由每日12,000噸增加為27,000噸。工程已於110年11月開工，預計112年11完工，可望有效削減三爺溪上游排水污染負荷，進而改善二仁溪水質。
水利局表示，「不淹水，乾淨水，親近水」是市府推動親水大臺南旗艦計畫之重要目標。水質淨化及水岸遊憩即為活化水岸重要一環，市府除積極辦理各項水質淨化設施，亦逐步推動沿岸景點營造及串連，將本市河川打造成優質生活環境，以創造「水清魚現、永續臺南」之願景。
